Вчені створюють новий атлас рослинних геномів

Дослідники з Forschungszentrum Jülich (Німеччина) представили PubPlant — відкриту базу даних, яка систематизує й візуалізує опубліковані геноми рослин. Інструмент оновлюється щомісяця та зводить у одному ресурсі дані, що раніше були розпорошені між різними репозитаріями.
Платформа дає змогу переглядати геноми за видами, родинами, роком публікації, якістю збирання та іншими критеріями, а також переходити до відповідних наукових публікацій і баз даних. Розробники наголошують, що ресурс був створений спочатку як внутрішній інструмент, однак через відсутність аналогів став публічним.
Стрімке зростання кількості секвенованих рослин — понад 500 нових геномів лише у 2024 році — робить питання впорядкування цих даних актуальним. За оцінкою авторів, PubPlant може спростити доступ до інформації для дослідників, селекціонерів та невеликих установ, а також висвітлювати таксони, для яких геномні дані досі обмежені.
Аналіз команди показав, що родини Poaceae, Fabaceae, Solanaceae, Rosaceae та Brassicaceae мають найповніше геномне охоплення, тоді як інші групи, зокрема Apiaceae чи Amaryllidaceae, досі недостатньо представлені. Розробники також зазначають, що інструмент може допомагати ідентифікувати прогалини у секвенуванні та підтримувати планування майбутніх досліджень.
Платформа залишається у розвитку: команда додає нові зв’язки до зовнішніх таксономічних ресурсів та планує подальші удосконалення, які не збільшуватимуть надмірно обсяг підтримки.
Повідомляє The Scientist

Популярні новини

Енергоефективність для фермерського бізнесу

Одним з найбільших споживачів енергії у народному господарстві України є сільськогосподарське виробництво. Так, агропромисловий комплекс України споживає 35 млн т умовного палива за рік, половина якого – у вигляді дефіцитного рідкого палива. Тому у найближчі роки необхідно поліпшити енергетичну базу сільськогосподарського виробництва, однак поки що ці завдання вирішуються без належного економічного обґрунтування.

Известково-серный отвар: фунгицид, инсектицид, акарицид

Некоторым веществам «не повезло» с репутацией. То, что называют «общественным мнением», часто формируется из мифов, тенденциозно поданных фактов и анонимного «мнения экспертов». Поэтому сера, как химический элемент, до относительно недавних времен стойко ассоциировалась с «нечистой силой» и алхимиками.

<!--:ru-->Совместимость удобрений при листовой подкормке<!--:-->

Листовая подкормка – прекрасный способ дополнить питание растений необходимыми элементами. Однако применение в растворе более одного компонента может вызвать выпадение осадка в виде нерастворимых солей.

Споживання м’яса в Україні наблизиться до мінімальної норми

Але збільшується поголів’я свиней та птиці в усіх категоріях господарств. У порівнянні з минулим роком кількість свиней зросла на 3%, а птиці – на 2,2%. Про це повідомила начальник Управління тваринництва та племінної справи Департаменту аграрного розвитку Мінагрополітики Олена Дадус під час конференції м’ясної галузі України «MeatForum». Вона відзначила, що поголів’я свиней та птиці більше […]

У Румунії швидко будується автомагістраль у напрямку українського кордону

Роботи тривають навіть вночі.